Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
H2al1nQ497L1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms