Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa20Q45VN2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa20Q45VN2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms