Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms