Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrc43Q3V0L5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc43Q3V0L5 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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