Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kdm5aQ3UXZ9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Kdm5aQ3UXZ9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms