Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pfdn4Q3UWL8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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