Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms