Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Skap2Q3UND0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms