Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx27Q3UHD6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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