Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lrrc58Q3UGP9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms