Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Q3U6N9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U6N9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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