Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssbp4Q3U4B1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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