Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf149Q3U2C5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms