Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Srsf6Q3TWW8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Srsf6Q3TWW8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Srsf6Q3TWW8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms