Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms