Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nlrp1aQ2LKU9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms