Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cntnap5bQ0V8T8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms