Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lrriq1Q0P5X1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrriq1Q0P5X1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms