Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vps8Q0P5W1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms