Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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