Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gata4Q08369 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms