Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Calb2Q08331 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Calb2Q08331 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms