Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnb1Q03717 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Kcnb1Q03717 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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