Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Msx2Q03358 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Msx2Q03358 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Msx2Q03358 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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