Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Hoxd1Q01822 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms