Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms