Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec23aQ01405 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms