Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EgfrQ01279 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms