Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HmgcrQ01237 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HmgcrQ01237 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HmgcrQ01237 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HmgcrQ01237 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgcrQ01237 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgcrQ01237 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgcrQ01237 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgcrQ01237 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgcrQ01237 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HmgcrQ01237 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgcrQ01237 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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HmgcrQ01237 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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