Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col1a2Q01149 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col1a2Q01149 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms