Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb2Q00977 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms