Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeleQ00690 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms