Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smarcc1P97496 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcc1P97496 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms