Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkaP97477 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkaP97477 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkaP97477 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkaP97477 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms