Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pitx2P97474 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms