Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psme1P97371 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Psme1P97371 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms