Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SgcgP82348 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcgP82348 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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