Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Otx2P80206 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms