Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snap25P60879 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snap25P60879 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms