Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhbdl3P58873 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl3P58873 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms