Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm2P58774 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms