Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp25P57080 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp25P57080 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms