Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp5P56399 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp5P56399 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp5P56399 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms