Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab4aP56371 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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