Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sh3bp1P55194 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sh3bp1P55194 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp1P55194 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sh3bp1P55194 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sh3bp1P55194 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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