Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nub1P54729 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nub1P54729 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nub1P54729 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nub1P54729 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nub1P54729 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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