Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TspoP50637 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TspoP50637 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms