Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxc13P50207 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxc13P50207 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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