Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BckdhaP50136 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms