Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tmod1P49813 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tmod1P49813 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmod1P49813 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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